MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 9613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_015562	ATTAA	2	10	1112382	1112391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_015562	AATAA	2	10	1112402	1112411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015562	A	9	9	1113233	1113241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015562	A	6	6	1113243	1113248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015562	ATTA	2	8	1113267	1113274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015562	ATT	2	6	1113308	1113313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015562	TCTT	2	8	1113317	1113324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_015562	A	6	6	1114548	1114553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015562	ATT	2	6	1114560	1114565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015562	A	6	6	1114567	1114572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015562	A	6	6	1114623	1114628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015562	TTA	2	6	1114630	1114635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015562	AT	3	6	1115285	1115290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015562	ATT	2	6	1115294	1115299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015562	A	6	6	1115310	1115315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015562	AT	3	6	1115347	1115352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015562	TTA	2	6	1115361	1115366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015562	A	6	6	1115371	1115376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015562	TA	3	6	1116248	1116253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015562	TAT	2	6	1116298	1116303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015562	TTC	2	6	1116305	1116310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015562	TGA	2	6	1116331	1116336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015562	CGA	2	6	1116363	1116368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_015562	GAG	2	6	1116414	1116419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015562	TAAA	2	8	1116426	1116433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015562	TA	3	6	1116449	1116454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_015562	ATTT	2	8	1116511	1116518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015562	CAC	2	6	1117186	1117191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_015562	A	6	6	1117249	1117254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015562	TTAAAA	2	12	1117255	1117266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015562	T	6	6	1117327	1117332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015562	TA	3	6	1117374	1117379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015562	TGAA	2	8	1117388	1117395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015562	TAT	2	6	1117472	1117477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015562	A	6	6	1117490	1117495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015562	AAG	2	6	1117518	1117523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015562	T	6	6	1119016	1119021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015562	T	6	6	1119035	1119040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015562	T	6	6	1119049	1119054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015562	AGT	2	6	1119128	1119133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015562	TTACT	2	10	1119151	1119160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6043	NC_015562	TTA	2	6	1119191	1119196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_015562	T	6	6	1119199	1119204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015562	AT	3	6	1119216	1119221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015562	GTA	2	6	1119226	1119231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015562	TA	3	6	1119252	1119257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_015562	AT	4	8	1120578	1120585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015562	TAT	2	6	1120598	1120603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015562	ATT	2	6	1120611	1120616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_015562	T	6	6	1120615	1120620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015562	A	6	6	1121002	1121007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015562	TGGA	2	8	1121013	1121020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015562	A	6	6	1121325	1121330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015562	ATG	2	6	1121363	1121368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015562	ATTTT	2	10	1121463	1121472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015562	CTAT	2	8	1121494	1121501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_015562	GGAT	2	8	1121599	1121606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015562	TAT	2	6	1122295	1122300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015562	A	8	8	1122314	1122321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015562	TAGT	2	8	1122322	1122329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015562	CAT	2	6	1123201	1123206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6064	NC_015562	AAAT	2	8	1123262	1123269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015562	TA	5	10	1123280	1123289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015562	CAA	2	6	1123371	1123376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_015562	ATT	2	6	1123400	1123405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015562	ATT	2	6	1124190	1124195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015562	AT	4	8	1124197	1124204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015562	AATAT	3	15	1124206	1124220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015562	GTT	2	6	1124224	1124229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6073	NC_015562	ATA	2	6	1124339	1124344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_015562	TTA	2	6	1125401	1125406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015562	A	6	6	1125410	1125415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015562	AAAG	2	8	1125417	1125424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6089	NC_015562	AATTAT	2	12	1127670	1127681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_015562	AATTTA	2	12	1128825	1128836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_015562	TTTCGA	2	12	1128905	1128916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6097	NC_015562	A	6	6	1128993	1128998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_015562	AT	4	8	1130145	1130152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015562	ATT	2	6	1130172	1130177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015562	T	6	6	1130182	1130187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015562	ATT	3	9	1130193	1130201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015562	TAA	2	6	1130217	1130222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015562	TTTA	2	8	1130250	1130257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015562	A	6	6	1130270	1130275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015562	A	6	6	1130277	1130282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_015562	TAA	2	6	1130283	1130288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6110	NC_015562	T	7	7	1130925	1130931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015562	AT	3	6	1130938	1130943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015562	AAT	2	6	1130957	1130962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015562	TTAA	2	8	1130963	1130970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015562	CA	3	6	1130974	1130979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_015562	AT	3	6	1131045	1131050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015562	TA	3	6	1131068	1131073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015562	AAT	2	6	1131089	1131094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015562	GGA	2	6	1131107	1131112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015562	A	6	6	1131380	1131385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_015562	CAT	2	6	1132485	1132490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_015562	A	6	6	1132531	1132536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015562	TCA	2	6	1132598	1132603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_015562	CA	3	6	1132606	1132611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_015562	TCG	2	6	1132664	1132669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015562	ATCT	2	8	1132701	1132708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_015562	TA	3	6	1132728	1132733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015562	AT	3	6	1132735	1132740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_015562	A	6	6	1132776	1132781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015562	T	6	6	1132896	1132901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015562	ATATT	2	10	1132918	1132927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_015562	AT	3	6	1132930	1132935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_015562	TAA	2	6	1132984	1132989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_015562	AT	3	6	1132994	1132999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_015562	ATA	2	6	1133005	1133010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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